Descubre la tecnología que amplia el potencial de NextSeq →
Millones de fragmentos de forma masiva a una gran velocidad y precisión con un coste óptimo
Nuestra plataforma utiliza el sistema NextSeq2000 de Illumina, que se basa en la secuenciación por síntesis (SBS), donde el seguimiento de los nucleótidos marcados se lleva a cabo de manera simultánea a la copia de la cadena de ADN.
Esta tecnología permite secuenciar millones de fragmentos de forma masiva y en paralelo, mejorando la velocidad y la precisión de secuenciación al tiempo que reduce su coste. El sistema de secuenciación Illumina NextSeq 2000 ha sido provisto con un novedoso sistema óptico de súper resolución que produce datos de imágenes de alta precisión con una mayor resolución y sensibilidad que los sistemas de Illumina más tradicionales.
Esta tecnología proporciona además mayor flexibilidad de secuenciación, escalable a diferentes necesidades experimentales de producción, y adaptable a aplicaciones tanto convencionales como emergentes.
La tecnología y el servicio que ofrece GENVIP desde esta Plataforma, proporciona ventajas particularmente importantes para las opciones de secuenciación de rendimiento medio. Algunas de las aplicaciones más comunes de este sistema son la secuenciación completa del exoma humano, la secuenciación del ARNm y la secuenciación de paneles de genes o dianas específicas. La flexibilidad de la tecnología hace que la plataforma sea adaptable a una amplia gama de aplicaciones y aplicable a proyectos con objetivos de secuenciación diversos:
El sistema Nextseq 2000 ofrece una gran flexibilidad para los estudios de secuenciación de ARN, que requieren diferentes profundidades de secuenciación y longitudes de lectura dependiendo de la complejidad, el tamaño y los objetivos del estudio:
Analiza las regiones codificantes y múltiples formas de ARN no codificante para obtener una imagen completa del transcriptoma.
Detecta y cuantifica transcriptos nuevos y conocidos para obtener perfiles de expresión completos y precisos.
Permite secuenciar conjuntamente múltiples librerías de ARN en una única carrera de secuenciación obteniendo una imagen rápida de los genes más expresados con sólo unas pocas lecturas por muestra.
Selecciona y secuencia transcriptos de interés específico para estudios de perfiles de expresión génica.
Permite consultar miles de secuencias de ARNs y microARN con una alta sensibilidad .
Secuencia el genoma completo de una bacteria, virus u otro microbio.
Captura y secuencia la región codificante de las proteínas del genoma, una alternativa rentable a la secuenciación de genoma completo.
Los paneles de genes dirigidos y de expresión génica dirigida secuencian solamente regiones genómicas o transcriptómicas de interés. Son herramientas útiles para analizar mutaciones específicas, carga mutacional, inestabilidad de microsatellites, genotipado de HLA, expresión del repertorio TCR o de de perfiles de fusiones génicas….Las aplicaciones de la secuenciación de paneles dirigidos incluyen:
Selección y secuenciación de regiones específicas del genoma que tienen un interés de investigación específico: por ejemplo, rutas biológicas específicas o experimentos de seguimiento de estudios de asociación de todo el genoma o secuenciación de genoma completo.
Contienen regiones genómicas fijas o genes asociados con una enfermedad, un fenotipo o una ruta biológica. Están disponibles para la investigación de diversas enfermedades como cáncer, trastornos hereditarios, trastornos raros, trastornos cardíacos, trastornos neurológicos, enfermedades inmunitarias...
Nuestro servicio incluye todas las etapas de soporte que necesite tu proyecto, desde la consultoría y asesoramiento experimental, hasta el apoyo técnico para el desarrollo de protocolos de secuenciación, la gestión de materiales, los análisis de las muestras y el correspondiente análisis de datos bioinformáticos para su publicación.
¿Qué es Single Cell?
La tecnología de 10x Genomics permite estudiar y entender mejor la complejidad celular desde diferentes perspectivas - ómicas a nivel de “una sola célula”: la combinación deinformación de diferentes capas - ómicas, transcriptómica, proteómica y epigenómica permitenelevar el potencial de los experimentos.
Disponible la Plataforma Chromium X Single en nuestro servicio NGS
Ventajas de la tecnología10x Genomics:
Opciones disponibles:
¡Single Cell está ya disponible!
La serie Chromium X permite acceder al análisis de células individuales en cualquier etapa.
Ofrece análisis de células individuales de manera coste-efectiva lo que le convierte en la tecnología adecuada para realizar cualquier ensayo de células individuales a cualquier escala y con la mayor flexibilidad.
¡Contáctanos y te ayudaremos a cumplir tus objetivos de investigación!
Nuestra plataforma de secuenciación proporciona asesoramiento experimental para una amplia variedad de proyectos de investigación que requieran:
Ofrecemos soporte técnico para el completo desarrollo del protocolo de secuenciación:
Proporcionamos la gestión y pedido de los reactivos necesarios para la preparación de las librerías de NGS, celdas de flujo y cartuchos para la aplicación de secuenciación requerida.
Entregamos los resultados en formatos de archivo de secuenciación que contienen los datos sin procesar y ofrecemos procesamiento y análisis especializados de datos NGS: control de calidad, de-multiplexación, alineamiento y análisis posteriores.
El grupo GENVIP es un equipo multidisciplinar de naturaleza transversal que engloba diferentes disciplinas en el ámbito de la investigación clínica y básica. GENVIP emplea las últimas tecnologías y métodos analíticos de las diferentes disciplinas para optimizar el tratamiento de los pacientes pediátricos y el abordaje de las enfermedades infecciosas desde el punto de vista del huésped.El objetivo principal del grupo de investigación GENVIP es profundizar en el conocimiento de la patogénesis de las enfermedades infecciosas que afectan a niños desde diferentes perspectivas, a través de una aproximación “ómica”.
Esta estrategia nos llevará a identificar biomarcadores genéticos, proteómicos y transcritptómicos que nos permitirán definir firmas asociadas al diagnóstico o pronóstico de las diferentes patologías infecciosas pediátricas basándonos en su fenotipo molecular. Además, este enfoque nos permite obtener y analizar información que podrá ser empleada de forma traslacional en la práctica clínica, contribuyendo al diagnóstico temprano, prevención selectiva y tratamiento de los pacientes pediátricos.
Este conocimiento también abrirá nuevas líneas para el estudio de tratamientos personalizados de los pacientes, contribuyendo al entendimiento y la predicción del impacto de los productos terapéuticos y las vacunas en el sistema inmune del niño.
Para más información sobre el servicio de la “Plataforma de secuenciación genómina, transcriptómica y análisis de datos” de GENVIP contacte por favor con:
Antonio Salas Ellacuriaga
antonio.salas@usc.es
Alberto Gómez Carballa
alberto.gomez.carballa@sergas.es
Isabel Ferreirós Vidal
isabel.ferreiros.vidal@sergas.es
Sistema de secuenciación Masiva (Next Generation Sequencing o NGS), con un amplio rango de aplicaciones en todos los estudios o proyectos de investigación que impliquen análisis de ácidos nucleicos.
